Ilya Khrykin Илья, официальное требование такое:
"Certificado de antecedentes penales o documento equivalente expedido por la autoridad competente de su país de origen o de aquel en el cual hayan residido en los últimos 5 años (mayores de edad)". По-русски: "Справка об отсутствии судимости или эквивалентный документ, выданный компетентным органом страны происхождения или страны, в которой они проживали в течение последних 5 лет (взрослые)".
Полагаю, в данном случае Вам лучше получить справку в японском МВД и поставить на нее апостиль, так как на справку, полученную в консульстве России в Японии, Вы апостиль поставить не сможете.
Ссылка:
https://serviciomigraciones.cl/residenciatemporal/actividadesremuneradas/

Илья, спасибо! Да, теперь получается, что справка из страны происхождения выгружается обязательно. Что неправильно по сути, так как человека могли увезти из России ребенком, русского языка он не знает, никаких российских документов у него нет, но в документах написано: родился в России. И теперь ему нужно будет доказывать, что он не верблюд, потому что справку о несудимости выдают по российскому паспорту. Нужно будет у консула спросить, есть ли возможность получить российскую справку о несудимости по, скажем, свидетельству о рождении российского образца.

Ilya Khrykin в Вашем случае можно было поступить проще. В разделе "Помощь в оформлении" приведены контакты компании "Право и слово" - они делают справку по скану паспорта. Они же эту справку отсканируют, а для подачи на визу в Чили бумажный оригинал не нужен, нужен только скан.
https://relocation.chileru.org/d/6-pomosch-v-oformlenii
Что касается "дурдома", как Вы пишете - увы, таковы правила легализации документов для других юрисдикций. Либо консульская легализация - но она будет признаваться только государствами, которые входят в консульский округ. Либо апостиль - но он ставится непосредственно в тех министерствах и ведомствах, которые выдали документ в России.
Также для получения справки о несудимости потребуется доверенность, так как справку считают документом, содержащим крайне конфиденциальную информацию. Более того: был момент, когда справку не выдавали даже по доверенности, а только непосредственно заявителю в руки. То есть приравнивали справку по правилам выдачи к паспорту. Я по этому поводу еще общался с нашим консулом в Чили, он делал дополнительно запрос в МИД.

KirillSizov Кирилл, очень рад, что консультация помогла! Я всегда говорю: переезд в другую страну - это большие траты и денег, и времени, и других ресурсов. Потратить на консультацию 40 долларов - незначительные затраты по сравнению с общей ценой вопроса. Мне всегда обидно за людей, которые на начальном этапе попадают в неприятные ситуации и потери денег, как говорится, на пустом месте. Потом они все равно попадают в наше сообщество, начинают общаться, узнают, что могли распорядиться своими ресурсами более рационально. Секретов у меня нет, все, что я знаю, пишу в Справочнике:
https://www.chileru.org
Если и после прочтения этих статей остались вопросы - пишите мне на relocation.chileru.org@gmail.com, договаривайтесь о консультации.

AntonCosmos на всякий случай: никакого "ВНЖ" в Чили нет. Есть временная виза.
По вопросам:

1. Временная виза по беременности не дает возможности подавать на постоянную визу через 1 год. Также нужно учесть, что виза для лечения и беременных в целом не должна давать право претендовать на постоянную визу: она выдается для решения конкретной задачи, т.е. лечения и рождения ребенка. После прохождения курса лечения и рождения ребенка владелец визы должен не оставаться на территории Чили, а возвращаться в свою страну.
   Поэтому Вам нужно изменить ее подкатегорию на визу по воссоединению семьи:
   https://serviciomigraciones.cl/residencia-temporal/cambio-de-subcategoria-o-calidad/
   Для этого нужно иметь действующее чилийское удостоверение личности и Единый ключ. Заявление на смену подкатегории необходимо подать не позднее чем за 90 дней до истечения действующей визы.
2. Да, если Ваша супруга имеет временную визу как titular, Вы в общем случае можете подать на визу как dependiente. Если не можете технически это сделать сейчас, сделаете, когда супруга изменит подкатегорию визы на воссоединение семьи с дочерью - гражданкой Чили.
3. Да, Вы как отец можете прямо сейчас подать на визу по воссоединению с дочерью - гражданкой Чили как titular. То есть Ваша миграционная ситуация даже несколько проще, чем у супруги.
   Что касается течения сроков для подачи на постоянную визу: у Вас он будет отсчитываться с момента скачивания Estamado Electronico, что касается супруги - скорее всего, у нее будет отсчитываться от момента изменения подкатегории визы на визу по воссоединению семьи.

AntonCosmos давайте сначала посмотрим, что это за виза, которую имеет Ваша супруга.
До введения нового Закона о миграции 21.325 в 2021 году существовал отдельный тип визы - для лечения и по беременности. Для ее получения нужно было предъявить справку от врача.
В новом законе две ситуации (лечение и беременность) разделили. Смотрим ст. 70 Закона о миграции:

Artículo 70 - Subcategorías.
...

p. 8. Extranjeros cuya residencia en Chile se justifique por razones humanitarias.
...
p.11. Pacientes bajo tratamientos médicos, siempre que acrediten que se harán cargo de los costos de su tratamiento médico.

Статья 70 - Подкатегории.
п. 8. Иностранцы, чье пребывание в Чили оправдано по гуманитарным соображениям.
п. 11. Пациенты, проходящие медицинское лечение, при условии, что они подтверждают, что будут нести расходы на свое лечение.
http://www.chileru.org/Закон_о_миграции#.D0.92.D1.80.D0.B5.D0.BC.D0.B5.D0.BD.D0.BD.D0.B0.D1.8F_.D0.B2.D0.B8.D0.B7.D0.B0_.D1.80.D0.B5.D0.B7.D0.B8.D0.B4.D0.B5.D0.BD.D1.82.D0.B0_.28residencia_temporal.29
Что такое "гуманитарные соображения" (razones humanitarias)? В Декрете 177 о подкатегориях временной визы рассматриваются 5 случаев:

1. Разрешение для жертв торговли людьми.
2. Разрешение для жертв домашнего или гендерного насилия.
3. Разрешение для жертв незаконного трафика мигрантов.
4. Специальное разрешение для беременных иностранок.
5. Разрешение для детей и подростков.

http://www.chileru.org/Подкатегории_временной_визы#.D0.93.D1.83.D0.BC.D0.B0.D0.BD.D0.B8.D1.82.D0.B0.D1.80.D0.BD.D1.8B.D0.B5_.D0.BE.D1.81.D0.BD.D0.BE.D0.B2.D0.B0.D0.BD.D0.B8.D1.8F
Таким образом, никакой отдельной "визы для беременных" в новом законе нет вообще. Есть только "Специальное разрешение для иностранок, оказавшихся в ситуации беременности" (Permiso especial para mujeres extranjeras en situación de embarazo), которое выдается из соображений гуманитарного характера, наравне с жертвами насилия и торговли людьми.
Теперь тонкий момент. На визу по гуманитарным основаниям могут подавать только уполномоченные чилийские организации, которые имеют право свидетельствовать соответствующую тяжелую жизненную ситуацию, в которой оказался иностранец. Однако с середины 2022 года на специальное разрешение для беременных иностранок технически можно подавать через сайт Миграционной службы. Ваша супруга получила как раз это спецразрешение.
На мой взгляд, гуманитарное спецразрешение по беременности только запутало ее миграционную историю. Если бы у нее вообще не было визы резидента, она бы заплатила очень небольшой штраф (просрочка до 180 дней - порядка 20 долларов США), подала бы на воссоединение семьи с дочерью-чилийкой сразу после рождения еще в декабре 2022 года, взяла бы Вас в качестве члена семьи, а через 1 год вы бы вместе подали на постоянную визу. Сейчас она не может ни изменить подкатегорию визы, ни подать на новую. Она должна ждать, когда ее гуманитарная виза закончится.
Что я бы посоветовал сделать.

1. Вы подаете на визу по воссоединению с дочерью-чилийкой прямо сейчас как титульный заявитель (titular).
2. Когда у Вашей супруги будет заканчиваться срок спецразрешения по беременности, она подает на визу зависимого члена Вашей семьи (dependiente).
3. Когда исполнится 1 год Вашей жизни с визой, Вы подаете на постоянную визу. В случае одобрения постоянной визы Вам, супруга получит постоянную визу автоматически как член семьи.

Sofia см. статью в Справочнике "Подача на временную визу", раздел "Шаг 10. Завершение подачи на визу и получение квитанции":
http://www.chileru.org/Подача_на_временную_визу#.D0.A8.D0.B0.D0.B3_10._.D0.97.D0.B0.D0.B2.D0.B5.D1.80.D1.88.D0.B5.D0.BD.D0.B8.D0.B5_.D0.BF.D0.BE.D0.B4.D0.B0.D1.87.D0.B8_.D0.BD.D0.B0_.D0.B2.D0.B8.D0.B7.D1.83_.D0.B8_.D0.BF.D0.BE.D0.BB.D1.83.D1.87.D0.B5.D0.BD.D0.B8.D0.B5_.D0.BA.D0.B2.D0.B8.D1.82.D0.B0.D0.BD.D1.86.D0.B8.D0.B8

Если есть зависимые члены семьи, то после оплаты за членов семьи необходимо снова зайти на сайт Миграционной службы, найти в Bandeja de entrada вашу заявку, щелкнуть по кнопке Realizar и пройти все экраны (будут показываться данные с последним введенным членом семьи), пока не появится форма с зеленой кнопкой Finalizar. Только после нажатия на нее заявка на визу со всеми зависимыми членами семьи отправится на рассмотрение и процесс подачи завершится.

Sofia у Вас должен быть чек об оплате. Он также приходит на почту.